历史沿革：临床药学系成立于2019年，前身是2005年创建的临床药学教研室。目前学系下设临床药学教研室和药事管理教研室。2006年开始招收四年制临床药学方向本科生；2008年获批为五年制临床药学专业，2010年获批硕士学位授权点；2012年获批博士学位授权点。2019年临床药学获批重庆市一流专业建设点，2020年临床药学专业获批国家级一流专业建设点。是国内率先开展高等临床药学教育，是重庆地区唯一的临床药学专业。临床药学系将以一流专业建设点为契机，做好专业建设规划，加强专业内涵建设，打造一流人才培养体系，为社会输送一流的临床药学人才。
师资队伍：临床药学系现有教师9名，包括5名教授和 3名副教授；博士研究生导师3名，硕士研究生导师5名。临床药学系教师毕业于美国天主教大学、英国阿斯顿大学、华西医科大学、华中科技大学、天津大学、吉林大学（白求恩医科大学）、厦门大学、陆军军医大学（第三军医大学）、哈尔滨医科大学、重庆医科大学等学校。其中3名教师在美国约翰•霍普金斯大学医学院、美国杜克大学、美国威斯康辛医学院从事过博士后研究工作。拥有中组部第五批“海外高层次人才计划”1名，重庆英才•优秀科学家1名，重庆英才•青年拔尖人才 1名，重庆市青年科技人才1名，WHO疫苗免疫战略组专家成员， WHO专家策略研究小组（十年疫苗工作小组）成员，WHO免疫战略咨询专家组（SAGE）成员，中华医学会成员（2011年至今 ），中国生物工程学会成员（2011年至今 ），中国药学会生物药品与质量研究专业委员会委员及重庆生物医药重大专项技术专家组成员，中国药理学会表观遗传药理学专业委员会委员和重庆市抗癌协会肿瘤标志物专业委员会常务委员。
人才培养：临床药学系承担太阳集团城娱8722临床药学专业、药学专业、药物制剂专业本科生开设专业课包括临床药理学、药物治疗学总论、临床药物治疗学（11个学科）、药师沟通 、中医中药学基础、生物技术制药、药事管理学、药物经济学、药学文献、药事管理学与GMP等近20门课程的理论教学。临床药学系在临床药学实习基地的建设和遴选的过程中做出了巨大的努力，目前拥有包括上海交通大学附属新华医院、中南大学湘雅医院、中国人民解放军解放军301医院等8家三级甲等医院。组建了一支拥有90人的临床药学实习基地带教师资队伍、带教师资中有82人持有临床药师资格证书，占比91.11%。并制定了药学部门、临床科室以及毕业药历的书写和答辩三步走的规范临床药学实习流程模式，培养的学生能够迅速进入临床药学部门工作，深受用人单位的欢迎。
教学成果：2011年“应用型药学人才培养模式创新实验区”获评为重庆市高校人才培养模式创新实验区。2012年“以疾病为主线的临床药学课程体系的研究与实践”项目获批重庆市教委重大教学改革研究项目。2013年“临床药学专业人才培养模式探索与实践”荣获重庆市人民政府高等教育教学成果三等奖。2014年“临床药学专业人才培养模式的改革”获批重庆市教委重大教学改革研究项目。2015年引进美国纽约州立大学布法罗分校太阳集团城娱8722药物治疗学课程。2016年“临床药学专业人才培养模式及机制研究”获校级教学成果一等奖。近5年参编主编各类相关教材10余部。近5年临床药学系学生在教师的指导下获得国家级各种奖项5项。
科学研究：近五年临床药学系获批国家自然科学基金项目7项，多项省部级课题。在PNAS、J Med Virol、J Exp Clin Cancer Res、Clin Transl Med、Hypertension等国际知名期刊发表具有影响力的SCI论文，单篇影响因子最高20.693。
社会服务：目前拥有国家卫生计生委临床药师培训基地3个。涵盖临床10个专业，已培养来自20个省、自治区、直辖市的临床药学学员百余名。现拥有4个《国家新药临床试验基地》，可开展新药临床试验涵盖30余个专业。临床药学学科与儿科学联合主办《儿科药学杂志》，是国内儿科药学领域唯一公开发行的专业学术刊物。药事管理学科一直承担重庆市执业药师继续教育和考前培训等任务，为重庆市执业药师队伍的建设和发展做出了巨大贡献，还承担了企业委托药物经济学相关研究项目多项，服务地方医药经济发展。
学术交流：近5年多名骨干教师先后参与了国内外学术会议、交流，以及到美国纽约州立大学布法罗分校、美国南卡大学等著名大学进修提高。
学系主任：于秀峰
学系秘书：张晓
学系成员：赵勤俭 冯涛 郑航 袁拥华 唐亚岚 肖斌 刘颜
